Zapewnia efektywny sposób projektowania trójwymiarowego, przy wykorzystaniu nowoczesnej technologii, umożliwiający projektowanie na zwizualizowanym obiekcie, co w znaczący sposób ułatwia poruszanie się w przestrzeni wirtualnej. MegaCAD w wersji 3D jest oparty na nowym jądrze do operacji 3D - ACIS. Wyposażony w moduł zapisujący historię tworzenia brył, gdzie umieszczone są wszystkie zdarzenia związane z powstaniem bryły lub zmianą jej geometrii. Umożliwia zawarcie wielu wariantów rozwiązań w jednym projektcie. Interaktywne połączenie 3D->2D - definiowanie dowolnych widoków lub przekrojów i przechodzenie z wybranymi z nich (jako rysunkami płaskimi) do automatycznie uruchomionej kopii systemu. W przypadku wprowadzania zmian w modelu 3D, rysunki 2D są automatycznie aktualizowane (do momentu zamknięcia kopii systemu).